Mae glanhau yn gam sylfaenol wrth gynnal cypyrddau ffeilio, ac mae dulliau'n amrywio yn dibynnu ar y deunydd. Ar gyfer cypyrddau ffeilio metel, defnyddiwch lliain meddal, sych i sychu llwch arwyneb. Os oes staeniau, lleithio lliain meddal gyda glanedydd gwanedig, ysgafn, niwtral a sychwch yn ysgafn; osgoi glanhawyr asidig, alcalïaidd neu gyrydol, gan y gall y rhain niweidio'r gorffeniad. Ar ôl glanhau, sychwch unrhyw leithder gyda lliain sych i atal rhwd a achosir gan ddŵr gweddilliol.
Mae glanhau cypyrddau ffeilio pren yn gofyn am sylw gofalus i reoli lleithder. Ar gyfer glanhau arferol, sychwch yr wyneb â lliain meddal ychydig yn llaith a'i sychu ar unwaith â lliain sych. Ceisiwch osgoi gadael i leithder gormodol dreiddio i mewn i'r pren, a allai achosi cracio neu warpio. Ar gyfer cypyrddau pren argaen neu lacr, peidiwch â defnyddio llathryddion cwyr, gan y gall y rhain adael yr arwyneb yn ludiog neu niweidio'r gorffeniad.
Wrth lanhau cypyrddau ffeilio gyda drysau gwydr, defnyddiwch lanhawr gwydr pwrpasol ac osgoi defnyddio offer caled a allai grafu'r wyneb gwydr. Triniwch y drysau'n ysgafn wrth agor a chau i atal y gwydr rhag torri oherwydd effaith.